18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3358 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3358  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 56 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  73.21 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3211  trimethylamine N-oxide reductase system TorE  69.09 
 
 		 58 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  66.07 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  66.07 
 
 		 56 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  64.29 
 
 		 56 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3211  periplasmic nitrate reductase NapE  69.23 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  64.29 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  64.29 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3350  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  69.23 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  69.23 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  52.73 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1996  periplasmic nitrate reductase NapE  67.86 
 
 		 56 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.450817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0989  warning TorE protein  50 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3341  periplasmic nitrate reductase NapE  51.85 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  40 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  40 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  32.08 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>