18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1118 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 56 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 56 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  98.21 
 
 		 56 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  98.21 
 
 		 56 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3350  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  82.76 
 
 		 58 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3211  trimethylamine N-oxide reductase system TorE  84.48 
 
 		 58 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3211  periplasmic nitrate reductase NapE  82.76 
 
 		 58 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  81.03 
 
 		 58 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3358  periplasmic nitrate reductase NapE  64.29 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  63.64 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0989  warning TorE protein  60.71 
 
 		 54 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  67.44 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  62 
 
 		 57 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3341  periplasmic nitrate reductase NapE  53.57 
 
 		 56 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1996  periplasmic nitrate reductase NapE  60.71 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.450817  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  43.4 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  45.45 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  45.45 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>