33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0774 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  64.41 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  62.07 
 
 		 59 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  62.07 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  50.88 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  49.06 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  49.02 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  49.02 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  45.61 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  46.94 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  48.72 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  45.61 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  44.9 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2729  hypothetical protein  42.31 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  44 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  43.4 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  48.89 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  43.4 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  43.4 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  47.37 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  41.51 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  46 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  46.51 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  38.18 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  47.73 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  40.68 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  47.83 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3211  trimethylamine N-oxide reductase system TorE  42.86 
 
 		 58 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  52.5 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  40.82 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3350  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  40.82 
 
 		 58 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3211  periplasmic nitrate reductase NapE  40.82 
 
 		 58 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  44.9 
 
 		 60 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>