28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4113 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  100 
 
 		 60 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  76.67 
 
 		 60 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  56.36 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  55.17 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  56.14 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  58.18 
 
 		 63 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  46.55 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  49.06 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  52.27 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  50.94 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  44.64 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  50.94 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  53.66 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  53.66 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  47.06 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  47.17 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  45.83 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  47.17 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  49.06 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  51.22 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  50 
 
 		 53 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 52 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  47.62 
 
 		 52 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4202  periplasmic nitrate reductase protein NapE  65.38 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  37.29 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  43.48 
 
 		 52 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  41.86 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  44.9 
 
 		 58 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>