29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2436 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  97.73 
 
 		 88 aa  174  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  87.23 
 
 		 54 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  87.23 
 
 		 55 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  44.44 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  52.27 
 
 		 53 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  52.27 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  53.49 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  52.17 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  50.98 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  43.75 
 
 		 52 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  50 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  53.66 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  46 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  49.02 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  41.67 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0365  putative periplasmic nitrate reductase NapE  68.09 
 
 		 49 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888571  hitchhiker  0.000141785 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  47.17 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  45.28 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  44.19 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  39.62 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  36 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  43.18 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2729  hypothetical protein  41.18 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  37.78 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  31.37 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  39.02 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>