25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0365 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0365  putative periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 49 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888571  hitchhiker  0.000141785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  68.09 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  68.09 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  63.27 
 
 		 54 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  63.27 
 
 		 55 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  48.84 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  46.94 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  45.45 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  46.51 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  51.16 
 
 		 52 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  46.51 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  42.86 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  48.98 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  41.3 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  46.67 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  39.13 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  51.22 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2729  hypothetical protein  46.51 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  42.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  45.24 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  39.58 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  40.91 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  40.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0989  warning TorE protein  35.42 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>