30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4761 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 
55 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  88.89 
 
 
54 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  87.23 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  85.11 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  54.55 
 
 
53 aa  57.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  58.14 
 
 
59 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  54.76 
 
 
73 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  48.15 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  46.15 
 
 
57 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  51.16 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  48.15 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  45.65 
 
 
52 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  43.48 
 
 
52 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  56.1 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  53.66 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  46.3 
 
 
59 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  56.1 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  47.83 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  55.26 
 
 
61 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  46.3 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  46.34 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0365  putative periplasmic nitrate reductase NapE  63.27 
 
 
49 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888571  hitchhiker  0.000141785 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  44.9 
 
 
58 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  41.67 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  45.83 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  43.75 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  40 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  37.78 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2729  hypothetical protein  46 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  41.46 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>