146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4007 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  331  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  91.93 
 
 		 375 aa  304  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  92.55 
 
 		 375 aa  304  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  92.55 
 
 		 375 aa  304  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  64.66 
 
 		 352 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  64.84 
 
 		 256 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  64.84 
 
 		 275 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  64.84 
 
 		 275 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  64.84 
 
 		 275 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  62.79 
 
 		 354 aa  177  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 354 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 354 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 354 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 354 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 354 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 354 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 354 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 341 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  58.91 
 
 		 327 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  58.14 
 
 		 331 aa  168  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  59.69 
 
 		 325 aa  167  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  62.02 
 
 		 319 aa  167  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 318 aa  167  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  61.24 
 
 		 318 aa  167  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  58.91 
 
 		 325 aa  167  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  62.02 
 
 		 294 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 363 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 342 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 342 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 349 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  52.71 
 
 		 342 aa  158  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  56.59 
 
 		 362 aa  157  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  56.59 
 
 		 362 aa  157  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 364 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 364 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 364 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 364 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 364 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 364 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 364 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  51.94 
 
 		 355 aa  148  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  55.28 
 
 		 438 aa  140  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0689  transposase, degenerate  59.81 
 
 		 186 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0838  hypothetical protein  59.81 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 347 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  49.59 
 
 		 347 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  58.16 
 
 		 317 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2768  transposase, degenerate  61.46 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2919  integrase, catalytic region  54 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 327 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 278 aa  120  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 		 310 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  43.85 
 
 		 327 aa  117  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  43.85 
 
 		 327 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  44.53 
 
 		 327 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>