57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3705 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  63.89 
 
 		 954 aa  1216    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  52.7 
 
 		 963 aa  958    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  52.71 
 
 		 955 aa  970    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  52.81 
 
 		 962 aa  942    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  52.63 
 
 		 962 aa  938    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  50.45 
 
 		 889 aa  868    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  49.29 
 
 		 983 aa  877    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  100 
 
 		 948 aa  1963    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  52.48 
 
 		 956 aa  941    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  64.61 
 
 		 952 aa  1219    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  64.13 
 
 		 954 aa  1226    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  54.22 
 
 		 913 aa  1001    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  52.08 
 
 		 969 aa  943    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  54 
 
 		 913 aa  997    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  52.59 
 
 		 962 aa  939    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  52.42 
 
 		 960 aa  942    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  51.04 
 
 		 973 aa  915    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  52.42 
 
 		 960 aa  917    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  52.09 
 
 		 949 aa  928    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  83.09 
 
 		 941 aa  1594    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  51.98 
 
 		 949 aa  947    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  53.52 
 
 		 978 aa  949    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  43.2 
 
 		 1042 aa  812    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  50.6 
 
 		 1002 aa  899    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  45.58 
 
 		 908 aa  813    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  49.73 
 
 		 980 aa  877    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  54.39 
 
 		 917 aa  1014    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  50.22 
 
 		 938 aa  923    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  52.38 
 
 		 955 aa  945    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  52.48 
 
 		 963 aa  954    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  38.11 
 
 		 964 aa  625  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  49.83 
 
 		 659 aa  592  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  29.2 
 
 		 924 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  28.68 
 
 		 916 aa  349  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  28.68 
 
 		 916 aa  349  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  56.89 
 
 		 240 aa  279  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.85 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  22.64 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.77 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.08 
 
 		 864 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  21.16 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.04 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.28 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  26.99 
 
 		 818 aa  51.2  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.51 
 
 		 629 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.79 
 
 		 861 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  22.42 
 
 		 862 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  22.42 
 
 		 862 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.7 
 
 		 629 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  22.42 
 
 		 862 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  22.42 
 
 		 862 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  30.07 
 
 		 569 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  22.42 
 
 		 862 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5557  cell division FtsK/SpoIIIE  37.18 
 
 		 1389 aa  45.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.18 
 
 		 1389 aa  45.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.62 
 
 		 630 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  26.58 
 
 		 1085 aa  44.3  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>