78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0080 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.82 
 
 
1821 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  41.88 
 
 
437 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  38.37 
 
 
981 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  37.5 
 
 
1009 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  37.71 
 
 
4630 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  40.37 
 
 
1048 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  34.25 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  43.62 
 
 
1732 aa  72  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  43.02 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  32.39 
 
 
892 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  31.08 
 
 
1831 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  39.29 
 
 
462 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  37.8 
 
 
2638 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  32.58 
 
 
576 aa  61.6  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  38.78 
 
 
1418 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  33.85 
 
 
1300 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  33.12 
 
 
867 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  35.29 
 
 
1937 aa  58.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  34.64 
 
 
1467 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30 
 
 
752 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  33.8 
 
 
316 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.73 
 
 
1732 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1630  major tail protein V  46.99 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0416885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  33.76 
 
 
556 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  34.46 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  37.5 
 
 
428 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  32.26 
 
 
1965 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  24.86 
 
 
472 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  30.6 
 
 
799 aa  52  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  25.43 
 
 
472 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  29.61 
 
 
570 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  27.91 
 
 
1279 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00742  hypothetical protein  45.78 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10046  tail component  45.78 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1068  Ig domain-containing protein  38.46 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.383445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  43.02 
 
 
389 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1088  Ig domain-containing protein  38.46 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.704248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  38.89 
 
 
372 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  42.42 
 
 
1077 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1296  major tail protein V  42.55 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1464  major tail protein V  42.55 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1192  major tail protein V  42.55 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2771  major tail protein V  42.55 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  35.92 
 
 
526 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2101  Ig domain-containing protein  45.68 
 
 
246 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  41.79 
 
 
554 aa  48.5  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0887  major tail protein V  42.55 
 
 
250 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
688 aa  48.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0948  Ig domain-containing protein  34.12 
 
 
129 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000631459  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  24.14 
 
 
1361 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  42.55 
 
 
1226 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1793  major tail protein V  42.53 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0821203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1869  major tail protein V  42.53 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0544232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3129  major tail protein V  42.53 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3197  major tail protein V  42.53 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352306 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  26.54 
 
 
466 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  30.6 
 
 
399 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  31.76 
 
 
983 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  41.89 
 
 
1193 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.62 
 
 
2122 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  33.72 
 
 
1316 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  41.18 
 
 
306 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2633  Ig domain protein group 2 domain protein  38.96 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000622078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  31.46 
 
 
572 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  29.56 
 
 
575 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  35.96 
 
 
1171 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  29.63 
 
 
1281 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4056  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000793338  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1313  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.20671e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1153  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1133  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000201206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1245  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1127  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  29.49 
 
 
1556 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  34.94 
 
 
536 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  32.73 
 
 
1421 aa  41.6  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  27.88 
 
 
657 aa  41.6  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>