22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0887 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0887  major tail protein V  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1296  major tail protein V  98.4 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1464  major tail protein V  98.4 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3197  major tail protein V  96.8 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000352306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3129  major tail protein V  96.8 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1869  major tail protein V  96.8 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0544232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1793  major tail protein V  96.8 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0821203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2771  major tail protein V  97.73 
 
 		 220 aa  424  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1192  major tail protein V  97.73 
 
 		 220 aa  424  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1630  major tail protein V  78.69 
 
 		 246 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0416885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10046  tail component  77.87 
 
 		 246 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00742  hypothetical protein  77.87 
 
 		 246 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2101  Ig domain-containing protein  76.42 
 
 		 246 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0905  gp13  56.17 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1148  gifsy-2 prophage VmtV  54.77 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1413  gifsy-2 prophage VmtV  54.77 
 
 		 249 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000750798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1076  gifsy-2 prophage VmtV  54.77 
 
 		 249 aa  277  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.016765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0700  gifsy-1 prophage VmtV  59.32 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.431888  hitchhiker  0.00024084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2804  gifsy-1 prophage VmtV  59.32 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.573055 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  42.55 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  39.77 
 
 		 1732 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  37.65 
 
 		 306 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>