21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2771 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2771  major tail protein V  100 
 
 
220 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1192  major tail protein V  100 
 
 
220 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1296  major tail protein V  99.55 
 
 
250 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1464  major tail protein V  99.55 
 
 
250 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3197  major tail protein V  97.73 
 
 
250 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0887  major tail protein V  97.73 
 
 
250 aa  424  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3129  major tail protein V  97.73 
 
 
250 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1869  major tail protein V  97.73 
 
 
250 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0544232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1793  major tail protein V  97.73 
 
 
250 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0821203 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10046  tail component  78.97 
 
 
246 aa  347  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00742  hypothetical protein  78.97 
 
 
246 aa  347  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1630  major tail protein V  78.04 
 
 
246 aa  345  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0416885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2101  Ig domain-containing protein  76.85 
 
 
246 aa  340  9e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1148  gifsy-2 prophage VmtV  53.27 
 
 
249 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1413  gifsy-2 prophage VmtV  53.27 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1076  gifsy-2 prophage VmtV  53.27 
 
 
249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.016765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0905  gp13  54.15 
 
 
247 aa  231  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0700  gifsy-1 prophage VmtV  58.25 
 
 
247 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.431888  hitchhiker  0.00024084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2804  gifsy-1 prophage VmtV  58.25 
 
 
247 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.573055 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  42.55 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  31.19 
 
 
1732 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>