29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1076 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1413  gifsy-2 prophage VmtV  99.6 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000750798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1076  gifsy-2 prophage VmtV  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.016765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1148  gifsy-2 prophage VmtV  99.6 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0905  gp13  69.36 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0700  gifsy-1 prophage VmtV  68.67 
 
 		 247 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.431888  hitchhiker  0.00024084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2804  gifsy-1 prophage VmtV  68.67 
 
 		 247 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.573055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1630  major tail protein V  57.61 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0416885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0887  major tail protein V  54.77 
 
 		 250 aa  277  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3197  major tail protein V  55.6 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000352306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3129  major tail protein V  55.6 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1869  major tail protein V  55.6 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0544232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1793  major tail protein V  55.6 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0821203 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1464  major tail protein V  55.19 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1296  major tail protein V  55.19 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00742  hypothetical protein  56.15 
 
 		 246 aa  274  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10046  tail component  56.15 
 
 		 246 aa  274  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2101  Ig domain-containing protein  54.96 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1192  major tail protein V  53.27 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2771  major tail protein V  53.27 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 1009 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  37.89 
 
 		 1732 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  35.96 
 
 		 1171 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  44.83 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  37.76 
 
 		 556 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  28.92 
 
 		 1831 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  38.1 
 
 		 981 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.47 
 
 		 1821 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  40 
 
 		 428 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  31.43 
 
 		 524 aa  42  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>