33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0905 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0905  gp13  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1076  gifsy-2 prophage VmtV  68.57 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.016765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1413  gifsy-2 prophage VmtV  68.57 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000750798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1148  gifsy-2 prophage VmtV  68.57 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0700  gifsy-1 prophage VmtV  76.27 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.431888  hitchhiker  0.00024084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2804  gifsy-1 prophage VmtV  76.27 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.573055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1630  major tail protein V  57.32 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0416885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1869  major tail protein V  57.49 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0544232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1793  major tail protein V  57.49 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0821203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3197  major tail protein V  57.49 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000352306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3129  major tail protein V  57.49 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117115 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0887  major tail protein V  56.68 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1296  major tail protein V  57.09 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1464  major tail protein V  57.09 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10046  tail component  55.28 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00742  hypothetical protein  55.28 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2101  Ig domain-containing protein  55.33 
 
 		 246 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1192  major tail protein V  54.84 
 
 		 220 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2771  major tail protein V  54.84 
 
 		 220 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  43.02 
 
 		 1009 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  41.86 
 
 		 981 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  48.53 
 
 		 1732 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  36.9 
 
 		 1171 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.19 
 
 		 1821 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  43.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  26.05 
 
 		 1831 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  33.94 
 
 		 556 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  39.24 
 
 		 428 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  35.79 
 
 		 1048 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  36.05 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  38.2 
 
 		 1300 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  37.93 
 
 		 526 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  38.64 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>