16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1088 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1068  Ig domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.383445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1088  Ig domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.704248  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  38.46 
 
 
220 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  36.56 
 
 
372 aa  47.4  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35.9 
 
 
1009 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  36 
 
 
981 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  33.33 
 
 
1732 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  36.14 
 
 
306 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0362  Ig-like domain-containing protein  33.71 
 
 
647 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  41.67 
 
 
1077 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  30.5 
 
 
1048 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  43.64 
 
 
1300 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  45 
 
 
570 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  26.8 
 
 
389 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.62 
 
 
1821 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  35.29 
 
 
556 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>