More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1463 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  99.41 
 
 		 339 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 339 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  99.71 
 
 		 339 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  80.24 
 
 		 338 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  78.17 
 
 		 338 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  76.99 
 
 		 338 aa  542  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  75.52 
 
 		 338 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  78.08 
 
 		 338 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  73.8 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  66.36 
 
 		 329 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  63.58 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  59.49 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  59.59 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  66.12 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  60.38 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  60.38 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  60.38 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  59.12 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  56.8 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  53.37 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  52.87 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  53.5 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  52.44 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  43.46 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  40.61 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  40.43 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  40.18 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  39.94 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  40.44 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.01 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  35.01 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  33.76 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.93 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  34.95 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  32.62 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.69 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  32.11 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  35.79 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  31.98 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 		 365 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 		 365 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  28.78 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  28.7 
 
 		 374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.65 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  27.01 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  26.33 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  25.39 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.4 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.32 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.31 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  26.65 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  26.25 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  26.72 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.7 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  26.55 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  28.05 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  29.69 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  28.19 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  27.53 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 423 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>