More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1471 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1471  response regulator receiver protein  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0303937  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1528  response regulator receiver protein  98.31 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01720  response regulator  55.17 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2972  response regulator receiver protein  51.65 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.538919  hitchhiker  0.000910386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 		 1266 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  29.63 
 
 		 1083 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 916 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  27.49 
 
 		 657 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  27.49 
 
 		 657 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  22.53 
 
 		 937 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  34.75 
 
 		 949 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 949 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.3 
 
 		 781 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1695  GacS/BarA family sensor protein  28.23 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1007 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 759 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.1 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 		 922 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  35.33 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  30.34 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1173  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 477 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  26.32 
 
 		 1098 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.89 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.69 
 
 		 1763 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 781 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  25 
 
 		 933 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  27.91 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 916 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2240  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573737  hitchhiker  0.00000360672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1285  response regulator receiver domain-containing protein  32.82 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0213798  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.74 
 
 		 929 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.23 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.06 
 
 		 921 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  36.75 
 
 		 594 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  34.85 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0142  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 1014 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.02 
 
 		 956 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1767 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.67 
 
 		 935 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2108  hypothetical protein  26.56 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  28.33 
 
 		 1439 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 917 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 654 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  38.55 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  38.55 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  38.55 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.34 
 
 		 932 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.89 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2439  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.26 
 
 		 1202 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  29.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  29.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  32.94 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  25.73 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  29.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 451 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.667822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 919 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  26.7 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  26.24 
 
 		 917 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1875  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  30 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6296  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.55 
 
 		 673 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312585  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1492  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 1029 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  26.98 
 
 		 904 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1176  hypothetical protein  26.77 
 
 		 442 aa  55.1  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1182  hypothetical protein  26.77 
 
 		 442 aa  55.1  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.23 
 
 		 917 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.18 
 
 		 935 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  31.93 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>