More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0928 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  67.95 
 
 		 765 aa  1015    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  69.46 
 
 		 749 aa  1058    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.03 
 
 		 765 aa  1009    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  59.53 
 
 		 787 aa  933    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 780 aa  1561    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.19 
 
 		 754 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  36.4 
 
 		 772 aa  438  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  34.25 
 
 		 740 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.5 
 
 		 743 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  35.94 
 
 		 721 aa  419  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  34.62 
 
 		 743 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 		 763 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  32.86 
 
 		 763 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 		 763 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  35.82 
 
 		 759 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.25 
 
 		 769 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.33 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  33.16 
 
 		 763 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 805 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  33.62 
 
 		 750 aa  398  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.7 
 
 		 778 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.7 
 
 		 778 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.92 
 
 		 751 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  34.18 
 
 		 764 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  34.26 
 
 		 764 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 		 769 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  33.75 
 
 		 759 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  37.87 
 
 		 764 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.85 
 
 		 738 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.58 
 
 		 762 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  33.87 
 
 		 768 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 		 766 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 		 763 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  31.97 
 
 		 765 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.81 
 
 		 733 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  31.99 
 
 		 766 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  34.17 
 
 		 765 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  31.72 
 
 		 755 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  31.85 
 
 		 755 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.96 
 
 		 772 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.63 
 
 		 768 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  31.85 
 
 		 755 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  31.97 
 
 		 755 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.2 
 
 		 777 aa  385  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.35 
 
 		 702 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 792 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.11 
 
 		 790 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.33 
 
 		 807 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 784 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.99 
 
 		 768 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  31.11 
 
 		 765 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.31 
 
 		 772 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.11 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.11 
 
 		 765 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.11 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.11 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  30.98 
 
 		 765 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.11 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.11 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 753 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.5 
 
 		 751 aa  365  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.33 
 
 		 757 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  34.38 
 
 		 802 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.69 
 
 		 771 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  31.01 
 
 		 739 aa  360  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.9 
 
 		 745 aa  360  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  30.63 
 
 		 765 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 		 782 aa  359  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  32.28 
 
 		 765 aa  359  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.13 
 
 		 804 aa  355  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.89 
 
 		 758 aa  353  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.32 
 
 		 723 aa  353  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.68 
 
 		 714 aa  352  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  32.69 
 
 		 817 aa  351  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.91 
 
 		 773 aa  351  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.12 
 
 		 785 aa  350  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  31.34 
 
 		 788 aa  349  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.46 
 
 		 783 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.73 
 
 		 756 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 		 760 aa  348  3e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.25 
 
 		 737 aa  347  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 751 aa  347  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  31 
 
 		 743 aa  346  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.51 
 
 		 752 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.87 
 
 		 778 aa  346  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.14 
 
 		 733 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.37 
 
 		 727 aa  344  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.37 
 
 		 727 aa  344  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  31 
 
 		 750 aa  342  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  31.48 
 
 		 808 aa  340  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3299  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 716 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  33.09 
 
 		 1037 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.29 
 
 		 790 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.98 
 
 		 755 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.88 
 
 		 762 aa  337  5.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.43 
 
 		 791 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.38 
 
 		 736 aa  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  33.12 
 
 		 723 aa  334  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  29.62 
 
 		 759 aa  334  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>