More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0483 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 343 aa  662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  65.67 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  67.96 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  61.14 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  61.16 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  57.57 
 
 		 366 aa  352  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  57.57 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  60.24 
 
 		 344 aa  345  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  55.56 
 
 		 335 aa  338  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  55.65 
 
 		 334 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  53.73 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  53.4 
 
 		 356 aa  295  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  50.3 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  49.85 
 
 		 351 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  54.84 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.65 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  49.1 
 
 		 334 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.71 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.1 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  48.01 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  47.62 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  47.22 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.77 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.99 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.73 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.37 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  47.19 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.44 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  45.57 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  45.57 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  44.82 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  46.39 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  42.81 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  45.63 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.29 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.73 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.29 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.29 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.9 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.97 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  36.05 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.13 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  36.06 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  36.34 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.22 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.15 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  31.6 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.63 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  36.54 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  29.6 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.92 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  33.97 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.86 
 
 		 320 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.64 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  34.49 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.02 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  31.87 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  34.49 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  33.44 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.37 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  31.91 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.88 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.53 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.81 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.55 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  32.58 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.67 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.41 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  38.19 
 
 		 342 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.44 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.67 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.63 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  37.45 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.13 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  31.11 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  35.07 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  36.08 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  27.88 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>