More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0342 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  65.77 
 
 		 549 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  100 
 
 		 572 aa  1093    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  60.31 
 
 		 515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  60.23 
 
 		 508 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  52.7 
 
 		 536 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  54.99 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  49.45 
 
 		 547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  50.09 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  50.28 
 
 		 525 aa  399  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  48.95 
 
 		 522 aa  395  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  42.86 
 
 		 496 aa  359  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  44.12 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  41.15 
 
 		 486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  41.18 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  39.81 
 
 		 490 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  40.19 
 
 		 494 aa  289  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  42.59 
 
 		 507 aa  289  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  42.59 
 
 		 507 aa  289  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  40.04 
 
 		 480 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  40.79 
 
 		 498 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  42.22 
 
 		 507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  40.34 
 
 		 509 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  41.45 
 
 		 505 aa  278  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  41.19 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  40.6 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  38.75 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  38.58 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  39.32 
 
 		 494 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  38.87 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  39.09 
 
 		 481 aa  216  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  39.42 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  32.78 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  41.78 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  39.71 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  29.68 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30.32 
 
 		 202 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  44 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  36.13 
 
 		 274 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  39.86 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  40.94 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.86 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  29.93 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.87 
 
 		 340 aa  67  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  42.18 
 
 		 286 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  29.93 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  29.53 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  36.22 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.69 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  29.03 
 
 		 206 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  40.14 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.18 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  35.71 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  35.9 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.22 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  36.13 
 
 		 382 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  34.55 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.4 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  34.06 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  37.86 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.84 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  31.72 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  35.48 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  30.23 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  41.94 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50510  predicted protein  26.33 
 
 		 647 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.58 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  43.55 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.14 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  38.03 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36.26 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  38.93 
 
 		 287 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  23.53 
 
 		 201 aa  57  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  34.34 
 
 		 403 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  38.46 
 
 		 210 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  33.06 
 
 		 278 aa  57  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.36 
 
 		 285 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.54 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  35.16 
 
 		 414 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.15 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.15 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  37.59 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  31.95 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  41.04 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.15 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  46.25 
 
 		 372 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  37.36 
 
 		 293 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  39.53 
 
 		 345 aa  55.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  35.11 
 
 		 287 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  40.48 
 
 		 284 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.13 
 
 		 293 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  40.31 
 
 		 274 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.75 
 
 		 289 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.5 
 
 		 322 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.53 
 
 		 280 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38 
 
 		 283 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  37.65 
 
 		 268 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  37.97 
 
 		 210 aa  54.3  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 311 aa  54.3  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>