More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4657 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4052  ABC transporter related  66.34 
 
 
612 aa  790    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0831351  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  68.04 
 
 
613 aa  806    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  70.03 
 
 
608 aa  814    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  100 
 
 
605 aa  1216    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  53.69 
 
 
553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  49.16 
 
 
577 aa  568  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
620 aa  487  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.83 
 
 
571 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  42.44 
 
 
578 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.08 
 
 
584 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  43.76 
 
 
629 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  44.63 
 
 
619 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  42.04 
 
 
575 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 
609 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.54 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 
703 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  43.27 
 
 
573 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  43.93 
 
 
631 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  44.79 
 
 
579 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.2 
 
 
643 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.59 
 
 
615 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
541 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.31 
 
 
609 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  42.86 
 
 
606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
623 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 
625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.05 
 
 
626 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.12 
 
 
661 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  42.56 
 
 
597 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.3 
 
 
593 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  43.08 
 
 
640 aa  445  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  42.17 
 
 
624 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.71 
 
 
625 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  42.74 
 
 
571 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 
708 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.09 
 
 
583 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
594 aa  442  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  40.99 
 
 
549 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  40.51 
 
 
627 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.29 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  40.45 
 
 
564 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
633 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.67 
 
 
586 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
573 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
637 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  43.17 
 
 
566 aa  439  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  42.83 
 
 
633 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  41.62 
 
 
610 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  42.66 
 
 
619 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  42.27 
 
 
572 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  42.66 
 
 
583 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 
547 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.32 
 
 
623 aa  438  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.54 
 
 
568 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  39.33 
 
 
617 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
593 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
601 aa  435  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.78 
 
 
611 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.05 
 
 
634 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 
632 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.79 
 
 
649 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.96 
 
 
617 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
548 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.64 
 
 
632 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.4 
 
 
619 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  41.99 
 
 
573 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.88 
 
 
634 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  42.81 
 
 
625 aa  435  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  40.64 
 
 
575 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  41.41 
 
 
570 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  41.36 
 
 
629 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.88 
 
 
634 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  42.38 
 
 
607 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.6 
 
 
658 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 
659 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  42.22 
 
 
611 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
601 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  42.88 
 
 
576 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  42.81 
 
 
640 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  42.59 
 
 
640 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.88 
 
 
611 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  42.17 
 
 
611 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  42.2 
 
 
613 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  42.9 
 
 
624 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  41.98 
 
 
558 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40.82 
 
 
546 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.35 
 
 
599 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 
633 aa  429  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  41.47 
 
 
564 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.34 
 
 
556 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  37.6 
 
 
647 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  41.21 
 
 
555 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  42.56 
 
 
545 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
631 aa  429  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  43.7 
 
 
547 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  39.05 
 
 
603 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  42.74 
 
 
624 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  39.78 
 
 
617 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  41.65 
 
 
531 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  40.82 
 
 
542 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>