More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1737 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  56.65 
 
 
224 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  54.49 
 
 
229 aa  204  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  52.6 
 
 
222 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  54.34 
 
 
225 aa  198  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  51.15 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  52.02 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  50.54 
 
 
226 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  51.93 
 
 
228 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  45.23 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  55.35 
 
 
217 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  59.12 
 
 
217 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  48.24 
 
 
223 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  45.73 
 
 
238 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  45.73 
 
 
238 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  44.79 
 
 
221 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  48 
 
 
224 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  44.38 
 
 
220 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  49.68 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  44.19 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  44.58 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  45.22 
 
 
216 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  43.53 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  43.53 
 
 
213 aa  151  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  47.71 
 
 
161 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.15 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  38.22 
 
 
232 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
191 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  42.42 
 
 
191 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  44 
 
 
223 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  39.52 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  41.94 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.61 
 
 
183 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  39.61 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  44 
 
 
187 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  34.55 
 
 
193 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  32.24 
 
 
194 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  29.47 
 
 
192 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  30.52 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.53 
 
 
195 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.31 
 
 
183 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.87 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.87 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
195 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
195 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  29.53 
 
 
195 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
177 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  39.42 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  29.58 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 
195 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  29.3 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  38.41 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.86 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.59 
 
 
202 aa  89  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  34.23 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  38.85 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  38.16 
 
 
422 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  31.91 
 
 
171 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  36.88 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 
446 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
191 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  33.61 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  36.48 
 
 
165 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.66 
 
 
194 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  28.47 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  34.46 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  34.27 
 
 
170 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  31.76 
 
 
168 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.86 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  32.21 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.39 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  27.39 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.39 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.25 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  36.42 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 
171 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  35.04 
 
 
168 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  32.62 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  28.03 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  36.75 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  27.39 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  30.34 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.37 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.85 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2757  putative thiol-disulfide oxidoreductase  33.78 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  26.11 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  37.12 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  40 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  30.99 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  31.68 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  32.92 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.46 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  35.14 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>