More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0681 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0681  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0111701  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  61.64 
 
 		 231 aa  285  7e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  59.36 
 
 		 231 aa  271  7e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  46.64 
 
 		 227 aa  214  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  48.2 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  48.2 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  46.58 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0266  ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000356629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  47.51 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  44.59 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  44.59 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  44.59 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  45.91 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  42.42 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  44.75 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  44 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  43.72 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  43.38 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  44.75 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  43.16 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  42.47 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  43.38 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  42.47 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  42.01 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  42.92 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  43.38 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  40.17 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  42.01 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  42.01 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  41.1 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  42.47 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  43.33 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  42.51 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  42.31 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  40.95 
 
 		 308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  41.98 
 
 		 217 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  41.43 
 
 		 214 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  40.58 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  40.57 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  40.18 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  41.9 
 
 		 211 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  40.09 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  38.65 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  38.03 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  40.95 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  39.05 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  39.42 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  41.2 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  37.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  39.42 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  40 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  39.52 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  39.81 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  40 
 
 		 212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  39.52 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  39.11 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 217 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  40 
 
 		 212 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  38.1 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  37.67 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  38.1 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  39.05 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0278  50S ribosomal protein L3  40.28 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000211938  decreased coverage  0.00000000129288 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34483  predicted protein  41.86 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000711163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0273  50S ribosomal protein L3  40.28 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000366458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0276  50S ribosomal protein L3  40.95 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000762346  normal  0.121842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0267  50S ribosomal protein L3  40.95 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000416166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  39.52 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  38.61 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  37.96 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2759  50S ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000332087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0348  50S ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000116037  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0327  50S ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000900525  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  39.61 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  41.06 
 
 		 208 aa  148  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  40.26 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  40.19 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  38.1 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  37.98 
 
 		 209 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0314  50S ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138197  hitchhiker  0.00855725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>