More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4803 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  932    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  87.8 
 
 
331 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  87.5 
 
 
331 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  87.62 
 
 
335 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  69.31 
 
 
335 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  67.56 
 
 
335 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.28 
 
 
333 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.68 
 
 
336 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.65 
 
 
327 aa  292  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.41 
 
 
328 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.67 
 
 
328 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.33 
 
 
328 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.85 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.92 
 
 
349 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 
328 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.69 
 
 
328 aa  282  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.07 
 
 
331 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.94 
 
 
345 aa  279  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.53 
 
 
345 aa  279  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  42.55 
 
 
333 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.95 
 
 
358 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 
328 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.55 
 
 
327 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
345 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.15 
 
 
336 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.86 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.57 
 
 
304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.77 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.48 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.85 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.41 
 
 
327 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  45.79 
 
 
327 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.41 
 
 
325 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  46 
 
 
327 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  273  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.27 
 
 
353 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.75 
 
 
326 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.99 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.29 
 
 
332 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  44.78 
 
 
322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.85 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.95 
 
 
331 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.52 
 
 
314 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41.32 
 
 
334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46 
 
 
335 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.15 
 
 
355 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 
348 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.25 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.06 
 
 
327 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.86 
 
 
324 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.21 
 
 
356 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42.62 
 
 
322 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.3 
 
 
318 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.09 
 
 
330 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.42 
 
 
339 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.8 
 
 
323 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.75 
 
 
335 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  47.16 
 
 
322 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
332 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  40.8 
 
 
326 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.06 
 
 
339 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.86 
 
 
325 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 
331 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  41.5 
 
 
331 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  46.18 
 
 
322 aa  261  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  43.85 
 
 
332 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.7 
 
 
344 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  41.46 
 
 
326 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.77 
 
 
331 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.32 
 
 
335 aa  259  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  43.87 
 
 
324 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 
328 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.54 
 
 
334 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.65 
 
 
333 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.88 
 
 
325 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.35 
 
 
329 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  43.09 
 
 
322 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 
327 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.81 
 
 
328 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.98 
 
 
334 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  43.18 
 
 
337 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.33 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.75 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.28 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.35 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  42.9 
 
 
329 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.05 
 
 
328 aa  254  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  40.94 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  43.39 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  44.11 
 
 
341 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.24 
 
 
325 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.18 
 
 
325 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.02 
 
 
334 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.8 
 
 
321 aa  253  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.41 
 
 
330 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  41.46 
 
 
326 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  42.33 
 
 
321 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>