More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2943 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  40.26 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  41.38 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  41.07 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  41.08 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  41.64 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  41.36 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  34.73 
 
 		 329 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  35.88 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  36.39 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  34.69 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  36.61 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  35.84 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  34.69 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  34.94 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  35.76 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  34.83 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  35.23 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  34.74 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  34.45 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  33.79 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  35.43 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  37.33 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.08 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  34.6 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  34.43 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  33.79 
 
 		 348 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.87 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.6 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.47 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  35.35 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.47 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  35.12 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  35.74 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  35.74 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  32.53 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  35.45 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.56 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  33.66 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  30.72 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  33.79 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  31.12 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  34.15 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  31.38 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.08 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  34.42 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  29.64 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  36.11 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  32.42 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  33.68 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  33.8 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  32.99 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.99 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  35.92 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.99 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  33.56 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  34.71 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  34.38 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  33.45 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.55 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  35.92 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.01 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  32.04 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  32.34 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0974  hypothetical protein  30.72 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  31.53 
 
 		 322 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  36.95 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  34.25 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  31.4 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  32.61 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4890  hypothetical protein  29.97 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.979482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.88 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  32.08 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  31.68 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  31.74 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  32.61 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  31.8 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  31.85 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  31.27 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  31.62 
 
 		 343 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  35.74 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  31.85 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  33.53 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  32.12 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  32.42 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  32.76 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  33.11 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  33.11 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  31.53 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  32.42 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  35.47 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>