94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2472 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5902  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  69.41 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3374  ABC transporter substrate-binding protein  83.98 
 
 		 415 aa  735    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1010  twin-arginine translocation pathway signal  84.53 
 
 		 431 aa  765    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617003  hitchhiker  0.00435801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2472  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 433 aa  893    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3269  twin-arginine translocation pathway signal  83.94 
 
 		 429 aa  760    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3534  twin-arginine translocation pathway signal  82.81 
 
 		 422 aa  722    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5257  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  70.19 
 
 		 431 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0208  twin-arginine translocation pathway signal  78.16 
 
 		 435 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0825185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1361  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  69.95 
 
 		 431 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.721333  normal  0.0486797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0101  ABC transporter substrate-binding protein  72.34 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0635162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4739  ABC transporter substrate-binding protein  71.07 
 
 		 426 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3943  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  71.57 
 
 		 420 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627454  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2893  putative ABC transporter substrate-binding protein  69.11 
 
 		 429 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2919  putative spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  57.96 
 
 		 432 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2658  putative spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  57.82 
 
 		 432 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6278  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  56.67 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3636  hypothetical protein  57.73 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4063  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic binding protein  57.22 
 
 		 421 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.797968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3337  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic binding protein  56.96 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1905  putative ABC transporter substrate-binding protein  45.25 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7129  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  45.5 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1002  hypothetical protein  37.66 
 
 		 412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1216  signal peptide prediction  37.05 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3722  signal peptide prediction  34.63 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5885  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  38.73 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3931  hypothetical protein  36.5 
 
 		 398 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4197  hypothetical protein  36.5 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2087  hypothetical protein  38.06 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2912  signal peptide prediction  34.52 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.511961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01580  signal peptide prediction  33.67 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5880  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  32.94 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0997  putative substrate-binding component of ABC transporter  33.51 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1052  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5836  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  31.67 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  23.58 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  22.98 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  24.41 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.61 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4308  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00256094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0815  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.12 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2141  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.18 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  24.21 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4498  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.94 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.76 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0853075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1703  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 398 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.59191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 348 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  22.95 
 
 		 348 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003484  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  22.19 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000109214  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02286  hypothetical protein  22.19 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4755  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.51 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3955  twin-arginine translocation pathway signal  21.64 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  20.34 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 357 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  21.28 
 
 		 366 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359474  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  21.18 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1188  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  24.19 
 
 		 362 aa  47  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3886  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.48 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3635  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.248377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  20.17 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  26.54 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2372  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  0.0187734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4671  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  21.2 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3222  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1704  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  21.45 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.89 
 
 		 345 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.28 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.53 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4497  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>