More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2156 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  82.75 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  71.76 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.87 
 
 		 261 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  57.87 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  56.3 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  59.06 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 		 261 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  56.62 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  53.79 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  55.91 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  55.79 
 
 		 247 aa  288  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 257 aa  284  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 		 278 aa  281  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54.9 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.91 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.71 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.28 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.17 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.99 
 
 		 263 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  52.36 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.8 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.1 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  52 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  52.8 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  51.41 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.6 
 
 		 592 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  51.2 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  50.58 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.91 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  49.61 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  51.75 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  51.54 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  52.57 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  51.21 
 
 		 255 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  52.17 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  51.37 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  52 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  52.57 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  50.79 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  50.99 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  49.61 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  50.38 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  49.05 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.79 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  52.8 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  50.78 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  49.8 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  51.19 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.38 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 242 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  50.8 
 
 		 243 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  51.56 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  50.19 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  52.4 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 240 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  50.8 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  49.61 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  51.2 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  51.2 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  51.67 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  51.6 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  50.8 
 
 		 269 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  49.6 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  51.78 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  49.41 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  52 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  51.2 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  49.21 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  49.8 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  49.21 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>