More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5962 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5962  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5628  hypothetical protein  69.7 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0980091  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.51 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.28 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  39.26 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.93 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  38.71 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.01 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.48 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.85 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.38 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  43.02 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  37.95 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.1 
 
 		 328 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.3 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.86 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.34 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.49 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.64 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.75 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.81 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.25 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.97 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.13 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  37.78 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.31 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  34.9 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.26 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5007  hypothetical protein  34.17 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.38 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.19 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.13 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  34.91 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  36.1 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.07 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.13 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.23 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.95 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.33 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.71 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  39.37 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  41.79 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.18 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  36.48 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.35 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.63 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  37.42 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  36.22 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  37.42 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.41 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  37.79 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.74 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.16 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1907  hypothetical protein  36.67 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.653438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.42 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.28 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  38.13 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  34.2 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.12 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  36.42 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  36.76 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  36.42 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  36.76 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  33.65 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  36.48 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  37.15 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  36.82 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  35.33 
 
 		 322 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  37.97 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  34.7 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.14 
 
 		 331 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  35.98 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  37.77 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.91 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.89 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  36.95 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.48 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  35.08 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  34.67 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  37.25 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.74 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.13 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  34.38 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  33.75 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.96 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  36.75 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  36.7 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  35.74 
 
 		 349 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  37.63 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.71 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.13 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>