157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5359 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  35.09 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.07 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  33.33 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  33.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  29.77 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  35.45 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  29.68 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  51.11 
 
 		 401 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  30.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  30.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  29.41 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  30.17 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3735  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 366 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.090934  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>