79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3378 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 323 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  62.24 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  63.95 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  64.26 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  63.24 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  64.2 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  64.16 
 
 		 337 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  58.44 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  61.96 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  56.33 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  42.48 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  38.67 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  39.87 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  38.29 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  31.97 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  35.51 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  31.48 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  36.7 
 
 		 357 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  36.7 
 
 		 357 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  34.08 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  35.19 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  31.61 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  34.54 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  33.54 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  34.98 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  32.32 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  34.53 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  38.11 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  31 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  24.85 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  32.18 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  35.05 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.38 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  34.89 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.08 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.97 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  27.59 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  25.82 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.71 
 
 		 338 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  31.29 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  26.99 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.31 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  25.88 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  27.97 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  27.97 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  26.53 
 
 		 417 aa  92.8  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  26.9 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  24.49 
 
 		 353 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  27.22 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  24.83 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  23.6 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  25.62 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  23.19 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.31 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.31 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  29.14 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  28.83 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  24.52 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  25.27 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  28.77 
 
 		 943 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  26.04 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  23.13 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  21.5 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.58 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  23.11 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  23.4 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  26.46 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  22.42 
 
 		 552 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  19.23 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  24.28 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  24.34 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  24.3 
 
 		 462 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>