More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1850 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  70.6 
 
 		 411 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  69.65 
 
 		 420 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 411 aa  335  7.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  46.02 
 
 		 422 aa  315  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  45.64 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 417 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  43.52 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  44.53 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 415 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 405 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  32.5 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  29.57 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  31.98 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  28.1 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.73 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  27.03 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  32.26 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.03 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  31.17 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  26.98 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  26.98 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  26.98 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  29.34 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  26.98 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  26.16 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.1 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  28.48 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.1 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  29.1 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  29.1 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  28.49 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  29.1 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  29.1 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  29.1 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  28.57 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  27.88 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  27.88 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>