108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0800 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0800  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 444 aa  869    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.453247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.99 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  24.37 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.62 
 
 		 458 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.33 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  29.03 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  29.25 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  27.86 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.7 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  27.33 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  27.76 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.25 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.12 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  29.97 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  24.22 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  26.18 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  26.1 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  25.24 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  25.43 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  30.9 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  27.6 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  25.79 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  28.34 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  28.86 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.19 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  27.48 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  25.41 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  32.9 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  24.38 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  26.3 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  28.66 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  29.66 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  29.51 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  26.33 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  26.76 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  27.83 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  27.44 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  25.91 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  34.92 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  27.3 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.97 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.45 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  24.29 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.31 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  24.24 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  27.34 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  28.28 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  27.92 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  27.88 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  27.44 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  27.41 
 
 		 454 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  25.37 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  26.63 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  27.02 
 
 		 462 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  27.27 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  24.49 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  26.91 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  26.44 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  27.15 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  25.98 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  26.05 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  23.81 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  26.37 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  27.19 
 
 		 476 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  28.49 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  27.1 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  28.42 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  28.42 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  27.1 
 
 		 503 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  25.79 
 
 		 469 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  28.43 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  25.23 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  26.13 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  27.87 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  30 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  26.1 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  26.23 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  24.46 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.53 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.32 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  26.41 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  24.33 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  25 
 
 		 482 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.57 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  22.14 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  29.76 
 
 		 453 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  25.18 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.31 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  25.18 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  22.3 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  27.91 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  24.21 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  25.18 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  28.03 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>