More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0333 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  75.57 
 
 		 397 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  77.97 
 
 		 398 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  100 
 
 		 401 aa  832    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  74.94 
 
 		 403 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  73.93 
 
 		 404 aa  626  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  72.93 
 
 		 401 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  72.68 
 
 		 401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  71.14 
 
 		 425 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  70.15 
 
 		 402 aa  591  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  68.7 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  66.25 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  61.68 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  61.36 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  61.42 
 
 		 396 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  61.36 
 
 		 396 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  61.11 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  63.45 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  60.61 
 
 		 398 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  60.35 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  58.63 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  57.72 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  57.32 
 
 		 396 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  57.47 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  56.57 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  56.57 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  56.57 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  52.87 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  56.71 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  52.22 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  52.22 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  51.67 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  51.41 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.79 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  51.15 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  51.15 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  50.79 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50.79 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.61 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  51.15 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.53 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.11 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  49.11 
 
 		 396 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.98 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.4 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  50.4 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.11 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  50.64 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50.26 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.1 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.11 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  49.11 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.4 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  49.37 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  48.98 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.16 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  49.74 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  47.59 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  45.96 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  50.26 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  49.22 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  50.52 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  48.82 
 
 		 379 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 		 412 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  49.22 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.59 
 
 		 396 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.31 
 
 		 388 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.88 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.88 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.88 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.88 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  50.26 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  47.51 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.56 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  47.62 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.62 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  47.62 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  46.17 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.62 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.17 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  46.17 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.58 
 
 		 401 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  49.48 
 
 		 404 aa  358  6e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.21 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  46.43 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  45.92 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.98 
 
 		 389 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  45.41 
 
 		 394 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  45.66 
 
 		 387 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.41 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.85 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  47.88 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  47.88 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  49.09 
 
 		 407 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  46.46 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>