53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0238 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  84 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  82.4 
 
 		 157 aa  223  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  82.4 
 
 		 157 aa  223  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  81.6 
 
 		 157 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  80.8 
 
 		 162 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  79.2 
 
 		 162 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  58.55 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  52 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  52 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  52 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  51.2 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  44.88 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  44.53 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  44.09 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  44.09 
 
 		 174 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  42.64 
 
 		 175 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  40.98 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  41.89 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  41.73 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  44.64 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  35.25 
 
 		 127 aa  87.8  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  37.1 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  34.96 
 
 		 125 aa  87  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  32.52 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  30.66 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  30.95 
 
 		 253 aa  70.5  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  32.61 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  34.53 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  30.47 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  34.43 
 
 		 276 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  32.64 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  30.38 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  32.81 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  29.46 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  31.62 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 287 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 280 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  26.53 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  27.19 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  28.87 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  28.21 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  27.67 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  26.52 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  25.62 
 
 		 138 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2299  hypothetical protein  27.37 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>