80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5224 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  308  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  43.7 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  38.69 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  35.88 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  36.76 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  37.59 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  38.02 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  34.19 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  32.82 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  32.82 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  31.75 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  30.97 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  33.8 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  31.52 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  25.76 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  29.1 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  27.61 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  29.23 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  31.34 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  36.59 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  32.5 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  31.52 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  32 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  30.48 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  31.3 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  29.2 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  26.98 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  28.45 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  28.26 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  30.84 
 
 		 173 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  30.09 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.07 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  27.54 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  29.55 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  29.55 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  28.71 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  29.2 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  28.45 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  26.56 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  26.55 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  27.72 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  28.18 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  30.38 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  25.86 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  23.93 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2034  protein of unknown function DUF1486  25.37 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  24.46 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  24.07 
 
 		 174 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  28.21 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  25.18 
 
 		 212 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>