107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0952 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  49.38 
 
 		 138 aa  84.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  39.82 
 
 		 286 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  39.82 
 
 		 286 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  38.94 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  34.21 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  34.51 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  34.02 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  31.9 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  33.62 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  34.23 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  29.57 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  30.65 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  31.52 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  31.15 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  29.82 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  41.43 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  30.97 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  40.26 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  25.23 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  28.46 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  40.24 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  33.63 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  30.97 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  31.62 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  30.97 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  27.42 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  35.79 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  26.61 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  28.81 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  40.91 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  28.21 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  26.61 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  30.36 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  28.32 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  28.07 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  35.8 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  29.46 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  26.87 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  35.8 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  29.71 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  37.5 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  32.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  35.37 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  35.37 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  34.57 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  37.5 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  29.46 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  30.86 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  29.63 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  37.04 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  39.34 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  39.34 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  23.66 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  24.79 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  35.82 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.86 
 
 		 316 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  28.45 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  24.62 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  26.79 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  26.32 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  24.77 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  28.57 
 
 		 284 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  25 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  37.35 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  32 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  32.39 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  27.27 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  32.88 
 
 		 162 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  27.2 
 
 		 176 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  30.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  30.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>