59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4491 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  99.22 
 
 		 128 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  89.06 
 
 		 128 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  89.06 
 
 		 128 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  89.06 
 
 		 128 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  78.91 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  65.62 
 
 		 134 aa  187  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  64.06 
 
 		 134 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  61.72 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  67.46 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  63.28 
 
 		 130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  64.71 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  64.84 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  60.94 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  58.59 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  60.16 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  56.25 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  64.46 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  56.45 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  57.26 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  53.39 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  48.44 
 
 		 286 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  48.44 
 
 		 286 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  47.66 
 
 		 286 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  33.59 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.97 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  26.72 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  28.95 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  29.75 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  29.21 
 
 		 284 aa  48.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  32.41 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  30.08 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  28.68 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  32.88 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  25.76 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  30.48 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  27.05 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  30.48 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  30.19 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  27.94 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  27.94 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 179 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  30.3 
 
 		 179 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  30.19 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  25.2 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  29.59 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  29.59 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  30.3 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  30.3 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  30.3 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>