55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2953 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  100 
 
 
138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  66.67 
 
 
134 aa  120  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  34.56 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  34.92 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  31.54 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  26.81 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  25.56 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  31.87 
 
 
137 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  27.13 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  28.23 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  30 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  27.05 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  29.21 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  23.2 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  31.58 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  31.65 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  27.78 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  27.46 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  22.05 
 
 
132 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  30.58 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  25.58 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  29.41 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  23.31 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  26.32 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  31.96 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  27.05 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  28.81 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  27.05 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  28.15 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  27.63 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  36.99 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  25.69 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2983  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  28.89 
 
 
212 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  28.17 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.26 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  32.05 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  29.33 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  25.41 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  26.53 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  26.23 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  32.89 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  25.74 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  21.09 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  25.41 
 
 
128 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  25.41 
 
 
128 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  25.41 
 
 
128 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>