43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5476 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  264  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  71.88 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  73.17 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  66.41 
 
 		 132 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  65.62 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  66.67 
 
 		 127 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  61.72 
 
 		 130 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  59.2 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  60.8 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  58.59 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  60.16 
 
 		 126 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  60.48 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  157  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  58.59 
 
 		 135 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  59.5 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  55.47 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  57.14 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  50.78 
 
 		 286 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  50.78 
 
 		 286 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  50 
 
 		 286 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.77 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  26.02 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  22.73 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  26.92 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  23.2 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  26.37 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  22.34 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  22.34 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  23.44 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  29.66 
 
 		 148 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  26.95 
 
 		 186 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  33.8 
 
 		 123 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  24.59 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  24.59 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  26.85 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>