30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4646 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 134 aa  276  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  57.14 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  55.46 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  52.94 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  52.07 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  58.82 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  57.63 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  53.72 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  55.93 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  53.39 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  51.26 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  53.39 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  52.54 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  52.54 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  52.54 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  53.39 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  50.42 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  50.83 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  51.3 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  47.06 
 
 		 286 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  47.06 
 
 		 286 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  44.54 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  47.11 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  46.22 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  45.54 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  30.63 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  24.77 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  28.87 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>