34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4437 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  259  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  66.39 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  64.71 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  63.41 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  63.87 
 
 		 128 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  61.79 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  63.41 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  61.79 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  60.16 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  60 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  56.1 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  57.72 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  54.62 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  52.85 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  52.85 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  57.14 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  57.14 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  51.26 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  57.14 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  48 
 
 		 286 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  48 
 
 		 286 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  47.2 
 
 		 286 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  28.81 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  30.77 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  26.98 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  27.97 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  28.09 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  28.57 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  23.85 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>