35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1135 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  66.39 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  62.5 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  65.04 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  62.5 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  62.5 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  57.46 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  58.33 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  58.59 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  59.38 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  61.79 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  56.62 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  54.48 
 
 		 134 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  53.91 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  56.25 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  57.85 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  54.62 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  53.85 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  53.91 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  50.83 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  43.75 
 
 		 286 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  43.75 
 
 		 286 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  42.97 
 
 		 286 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  23.16 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  23.16 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  29.76 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  27.78 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  26.92 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  24.42 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  30.59 
 
 		 134 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>