34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0619 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  267  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  60.94 
 
 		 132 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  61.72 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  60.94 
 
 		 135 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  62.6 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  59.38 
 
 		 134 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  59.5 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  56.25 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  54.69 
 
 		 138 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  53.91 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  53.91 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  53.12 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  52.34 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  54.62 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  53.12 
 
 		 134 aa  140  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  49.59 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  51.3 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  42.97 
 
 		 286 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  42.97 
 
 		 286 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  42.97 
 
 		 286 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  26.83 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  25.53 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  25.53 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  24.79 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  25.78 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  28.38 
 
 		 140 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  27.72 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>