40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6920 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  64.06 
 
 		 134 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  64.84 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  61.72 
 
 		 138 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  60.94 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  60.94 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  62.6 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  60.94 
 
 		 151 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  60.16 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  61.72 
 
 		 135 aa  159  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  157  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  58.82 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  57.81 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  61.98 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  53.91 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  57.72 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  56.1 
 
 		 138 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  57.63 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  46.88 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  46.88 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  46.09 
 
 		 286 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.97 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  29.63 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  31.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  27.05 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  29.36 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  24.73 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  24.73 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  27.66 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>