31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2712 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  67.19 
 
 
134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  66.92 
 
 
134 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  65.62 
 
 
128 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  60.94 
 
 
128 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  170  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  58.59 
 
 
132 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  59.23 
 
 
130 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  59.38 
 
 
151 aa  164  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  62.6 
 
 
127 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  61.79 
 
 
126 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  56.62 
 
 
136 aa  155  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  55.97 
 
 
135 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  54.69 
 
 
128 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  53.6 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  53.66 
 
 
126 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  53.12 
 
 
134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  55.37 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  53.72 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  46.09 
 
 
286 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  46.09 
 
 
286 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  43.48 
 
 
286 aa  121  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  27.42 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  28.7 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  27.34 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  29.21 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  25.56 
 
 
284 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>