52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5702 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  89.06 
 
 
128 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  88.28 
 
 
128 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  78.12 
 
 
151 aa  213  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  63.28 
 
 
134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  63.28 
 
 
134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  63.28 
 
 
128 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  68.29 
 
 
127 aa  176  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  64.06 
 
 
128 aa  176  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  61.72 
 
 
138 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  62.5 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  65.04 
 
 
126 aa  170  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  62.5 
 
 
136 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  61.72 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  61.29 
 
 
126 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  57.81 
 
 
134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  59.38 
 
 
132 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  55.47 
 
 
128 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  58.06 
 
 
138 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  61.16 
 
 
135 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  52.54 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  46.09 
 
 
286 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  46.09 
 
 
286 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  45.31 
 
 
286 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  31.86 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  28.45 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  30.7 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  32.08 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  32.08 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  28.93 
 
 
142 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  30.48 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  30.3 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  30.3 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  28.09 
 
 
284 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.91 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  25.2 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  31.51 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  24.39 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  28.68 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  29.55 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  23.33 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  30.14 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  27.56 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  23.58 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  22.22 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  29.84 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  25.41 
 
 
138 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>