101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4914 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  79.56 
 
 
137 aa  239  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  34.48 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  31.06 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30.88 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  29.63 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  39.78 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  38.61 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  33.59 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  37.04 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  28.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.37 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.37 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  42.5 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.78 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  29.01 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  31.39 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  31.34 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.35 
 
 
316 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.16 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  26.67 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  27.2 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  30.65 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  25.6 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  25.6 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  25.6 
 
 
179 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  25.56 
 
 
157 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  26.52 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  24.06 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  25.6 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  28.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  29.71 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  36.99 
 
 
187 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  31.71 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  25.6 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  24.8 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  25.6 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  24.8 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  25.55 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  32.43 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  24.8 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  25.53 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  26.15 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  26.15 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  36 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  35.71 
 
 
331 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  26.15 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  22.31 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  26.92 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  30.07 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  32.5 
 
 
212 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  31.08 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  22.48 
 
 
284 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  27.43 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  29.41 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  25 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  31.33 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  28.38 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  25.81 
 
 
186 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1448  hypothetical protein  28.24 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  28.38 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  28.38 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  28.38 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  28.38 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  28.38 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  28.38 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  25.74 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  31.25 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  37.29 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  26.58 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  23.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  29.11 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  25.66 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  26.52 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  31.08 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  26.15 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2983  protein of unknown function DUF1486  27.59 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  28.75 
 
 
143 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  22.48 
 
 
144 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 
145 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  24.41 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  23.77 
 
 
126 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  30.41 
 
 
153 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  22.22 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  27.66 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  26.05 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  24.59 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1161  protein of unknown function DUF1486  25.98 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0776  protein of unknown function DUF1486  26.88 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>