98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4925 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  79.56 
 
 
137 aa  239  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  33.1 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  31.34 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  32.35 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  34.62 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  31.75 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  30.47 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  36.56 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  31.43 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  34.81 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  30.94 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  32.85 
 
 
173 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  32.82 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  38.75 
 
 
182 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  30.16 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.06 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  28.03 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  28.46 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  29.2 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  32.41 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  24.63 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  38.16 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  38.16 
 
 
185 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  28.47 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  28.47 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  31.58 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  27.48 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  37.18 
 
 
187 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  25.19 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.21 
 
 
316 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  32.89 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  27.01 
 
 
179 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  27.74 
 
 
182 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  32.93 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  25.76 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  27.43 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  27.01 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  27.74 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  34.15 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  35.14 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  28.89 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  35.14 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  34.69 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  35.14 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  31.91 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  24.06 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  27.13 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  26.98 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  35 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  24.29 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  29.76 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  31.76 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  25.95 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  25.95 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  25.95 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  24.03 
 
 
284 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  26.32 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  36 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  25.4 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  26.52 
 
 
163 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 
134 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  38.96 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  31.08 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  36 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  33.75 
 
 
212 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  25.41 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  25.58 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  27.69 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  32.5 
 
 
214 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  28.68 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  28.68 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  28.68 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  24.09 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  23.02 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  28.79 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2725  protein of unknown function DUF1486  29.27 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00391008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  24.44 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  21.32 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  27.16 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 
402 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  21.32 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  23.6 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  24.59 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  33.87 
 
 
345 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  29.11 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  28.74 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1448  hypothetical protein  28.37 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  37.78 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  26.72 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>