89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1394 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  98.38 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  81.08 
 
 		 185 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  82.16 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  82.16 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  62.23 
 
 		 187 aa  224  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  74.17 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  72 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  72 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  72 
 
 		 185 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  72 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  72 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  72 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  72 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  62.82 
 
 		 186 aa  207  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  52.25 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  56.07 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  65.67 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  57.14 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  55.64 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  55.64 
 
 		 212 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  37.87 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  40.82 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  40.54 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  37.28 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  41.78 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  35.98 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  35.98 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  40.41 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  37.9 
 
 		 142 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  36.72 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  39.66 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  38.71 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  43.53 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  31.2 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  35.79 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30.4 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  38.75 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  34.04 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  31.62 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  33.7 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  38.16 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  37.84 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  28.95 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  30.77 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  34.41 
 
 		 123 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  30.77 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  32.99 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  32.65 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  32.08 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  32.08 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  32.08 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  29.17 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  29.49 
 
 		 284 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.86 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  31.52 
 
 		 126 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  27.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  32.79 
 
 		 85 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  25.64 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.58 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  31.08 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  29.35 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  29.35 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  28.45 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  34.62 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  30.38 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  30.48 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  29.27 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  30.48 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  41.3 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0524  hypothetical protein  26.09 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  34.57 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  30.69 
 
 		 130 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  24.06 
 
 		 137 aa  42  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  31.87 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>