96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1469 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  96.76 
 
 
185 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  82.16 
 
 
185 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  82.16 
 
 
185 aa  287  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  63.98 
 
 
187 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  77.63 
 
 
186 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  75.84 
 
 
185 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  75.84 
 
 
185 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  75.84 
 
 
185 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  75.17 
 
 
185 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  75.17 
 
 
185 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  75.17 
 
 
185 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  75.17 
 
 
185 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  64.52 
 
 
186 aa  207  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  53.37 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  54.34 
 
 
181 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  61.59 
 
 
180 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  54.68 
 
 
214 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  53.96 
 
 
214 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  52.86 
 
 
212 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  52.63 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  37.95 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  35.93 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  35.93 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  40.14 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  36.75 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  38.16 
 
 
179 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  39.73 
 
 
182 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  35.93 
 
 
179 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  38.51 
 
 
182 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  38.51 
 
 
179 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  40.94 
 
 
142 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  35.43 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  38.04 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  33.06 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  34.4 
 
 
138 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  28.03 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  35.54 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  42.86 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.48 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.81 
 
 
151 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  32.5 
 
 
131 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  32.48 
 
 
132 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  32.43 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  29.63 
 
 
138 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  34.02 
 
 
157 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  28.87 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  26.52 
 
 
141 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  30.97 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  31.15 
 
 
144 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  30.22 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  29.06 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  35.8 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  35.14 
 
 
137 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.21 
 
 
139 aa  51.2  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  30.1 
 
 
123 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  32.47 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  28.21 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  20.74 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  28.21 
 
 
284 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  31.73 
 
 
126 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  38.71 
 
 
149 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  27.5 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  35.9 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  35.9 
 
 
152 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  27.5 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  26.39 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  26.15 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  21.88 
 
 
149 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  26.5 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  31.15 
 
 
85 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.58 
 
 
316 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  29.03 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  30.56 
 
 
255 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  30.43 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  26.92 
 
 
242 aa  44.7  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  29.27 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  30.28 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  29.27 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  29.27 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.05 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  32.97 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  26.32 
 
 
133 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  43.48 
 
 
319 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  29.5 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  28.23 
 
 
162 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  29.87 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>